生物信息分析

组装是基因组学研究的地基。我们依托 PacBio HiFi、ONT 超长读长与 Hi-C 等技术，完成从 de novo 到染色体级直至 T2T（端粒到端粒）的高质量组装，并构建泛基因组 / 超级泛基因组、开展结构与功能注释，为下游群体、定位与育种分析提供可靠参考。

服务内容包括：组装策略评估、HiFi/ONT/Hi-C 数据联合组装、染色体挂载与 T2T 补洞、重复序列与着丝粒解析，以及基于多证据的基因结构与功能注释。交付标准化的组装序列、注释文件与统计报告，可直接用于后续群体与育种分析。

面向大规模重测序群体，我们提供从变异检测到群体结构、遗传多样性、进化与选择清除的全流程分析，帮助厘清种群的遗传关系、驯化历史与优异等位变异。

分析内容涵盖变异过滤与质控、系统发育与群体结构、连锁不平衡与遗传多样性、主成分与聚类、群体分化（Fst）以及 XP-CLR、iHS 等选择清除检测。可结合表型与地理信息开展环境关联，为种质评价与驯化研究提供数据支撑。

围绕重要农艺性状，我们整合 GWAS、遗传图谱与 QTL 定位、BSA 及其变体等多种策略，并针对特殊群体或性状定制方案，高效锁定候选基因与分子标记。

从群体设计、标记密度与统计模型选择，到关联信号检验、候选区间注释与候选基因功能解读，我们覆盖完整流程。可综合 GWAS、QTL 与 BSA 结果进行多策略交叉验证，提高定位的稳健性与可信度。

面向学术科研，我们帮助构建与优化全基因组选择模型，聚焦预测方法学与模型评估，支撑方法探索与科研论文产出。

分析涵盖表型与基因型数据清洗、群体划分与交叉验证设计、多算法（GBLUP、贝叶斯、机器学习等）建模、预测精度与稳健性评估，以及方法比较与可复现流程。适合开展预测方法学研究与论文方法部分支撑。

我们将基因组、转录组、蛋白质组、代谢组与表观组等多层数据联合解析，构建基因型—表型调控网络，揭示复杂性状的分子机制。

从多组学数据预处理与质控，到关联网络构建、差异与共表达分析、通路富集与调控推断，我们打通组学间的数据链路。可选单细胞、空间转录组等前沿数据整合，输出可用于论文的调控网络与机制解读。

我们为科研单位搭建基因组浏览器、BLAST、GWAS 位点查询等多组学数据库与分析平台，实现数据资产化保存、团队共享与在线复用。

平台集成数据导入与管理、基因组浏览、BLAST 与位点检索、可视化查询与权限管理等功能，并支持流程编排与结果复现。我们提供从需求梳理、库表设计到部署上线与培训的完整实施，确保平台可持续使用。

针对个性化科研需求，我们提供定制化分析、出版级高级图表绘制与论文合作，从数据到成稿全程支持，支持成果发表。

从科学问题拆解、分析方案设计到结果解读与图表打磨，我们提供一对一的高质量定制服务。可视化涵盖 Circos 圈图、共线性图、进化树、热图、网络图、曼哈顿图、森林图与三维基因组图谱等出版级图件。